科技名词
桑格-库森法
sanger-Coulson method sanger-Coulson方法
定义:英国生物化学家桑格和库森等人发明的DNA测序法。即使用能在DNA模板链上互补参入却不能延伸的四种双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)与正常的四种脱氧核苷三磷酸(dNTP)竞争,合成的互补链可以在任何位置终止,获得长短不一的反应产物,通过电泳分离,从四条泳道上的条带顺序就能读出DNA的序列。是目前DNA测序的首选方法。
学科:生物化学与分子生物学_方法与技术
相关名词:测序技术 脱氧核苷三磷酸 双脱氧核苷三磷酸 凝胶电泳
【延伸阅读】
桑格-库森法是一种被广泛应用的DNA测序技术,也是人类基因组计划使用的主要测序技术。1975年,英国生物化学家弗雷德里克·桑格和库森发明了该技术,桑格因此在1980年第二次获得诺贝尔化学奖。早在1958年,桑格就因破译胰岛素分子的氨基酸排列顺序获得过诺贝尔化学奖。
桑格-库森法的基本原理是以待测DNA分子为模板,利用与待测DNA分子5′端特异性互补配对的引物,通过DNA聚合酶,进行体外DNA合成反应。每一次序列测定由4个独立的反应构成,每个反应体系中含有4种脱氧核苷三磷酸dNTP(dATP,dGTP,dTTP,dCTP)和1种双脱氧核苷三磷酸ddNTP(ddATP,ddGTP,ddTTP,ddCTP)作为底物。在DNA聚合酶的作用下,4种dNTP能够正常参与DNA新链的延伸。但是由于ddNTP缺少了3-OH基团,无法与相邻的dNTP形成磷酸二酯键,因此ddNTP加入到新合成的DNA链后会导致新链终止延伸。最终4个反应体系形成由一系列长度不同、且3′末端都带有一个ddNTP的DNA新链所组成的反应产物混合物。然后再通过凝胶电泳,分离4个反应体系中含有各ddNTP的反应产物。由于反应产物中掺入DNA新链的各ddNTP的位置即为待测DNA分子中各dNTP所处的位置,而且根据反应产物的相对分子量越小,其掺入ddNTP的位置越靠近待测DNA分子5′端的原则,就能够通过依次读取凝胶中的各ddNTP,获得待测DNA分子的碱基排列顺序。
随着检测技术的发展和更新,桑格测序法又与荧光自动检测技术和毛细管电泳技术相结合。毛细管电泳技术的优势是使分离DNA分子的分辨率能够达到一个碱基。在DNA合成反应中,将4种ddNTP标记4种不同的荧光基团,当带有荧光基团的DNA片段通过毛细管末端的激光发射器时,荧光基团发射出特定波长的光,经过探测器和电脑转变为其所对应的核苷酸,即可直接读取DNA的碱基序列。这使DNA测序技术操作更加简便,而且准确度更高,应用也更加广泛。
(延伸阅读作者:东北师范大学生命科学学院 张帆博士)